藤堂高虎公が紀州粉川より伊予今治に移る際、粉川超誓寺住職暁誉上人も共に移り、今治の地に大善寺を造営。慶長十三年高虎公が伊賀・伊勢を領するや上人も再度従い、上野にて大善寺を開いた。高虎公は叔父藤堂玄蕃が関ヶ原にて戦死しており、その菩提を弔うため、この寺を建造した。代々、藤堂玄蕃の菩提寺、伊賀中本山として繁栄した。暁誉上人は後に超誓寺を建てた。明治八年大善寺・超誓寺を合併、「大善超誓寺」とし、さらに明治二十二年大超寺と改称し今日に至る。